虽然只是新晋的真神尊者，但这关乎整个宇宙生死存亡的战斗，慧明自然也是参加了。
这一战，无比惨烈，一位位尊者陨落，而后又修炼出分身杀进混沌飞舟。母祖教一方的尊者们，更是连在他们家乡宇宙的本尊都带来了，显然抱着必死的决心。幸好最后关头，东伯雪鹰将那黑葫芦认主，借助黑葫芦的可怕威能杀死了母祖教一方所有的护法尊者。
其间，最大的意外便是竹山府主的背叛了。原来，竹山府主本是母祖教一方的护法，在这一方宇宙中投胎转世，成神后恢复了记忆，结合两个文明的修炼体系，迅成长起来甚至在四重天界神时就开辟了毁灭雷霆之道，拥有了真神尊者的实力，且在真神尊者中都是实力比较顶尖的。
不过，就在竹山府主突然叛变出手要杀死涟君星主时，却现涟君星主身上竟然有着防御属性的真神器。
而紧接着，慧明也是展露了法身，借助法身爆出了可怕的攻击威能。一掌出，威能几乎堪比主宰的慧明，在竹山府主震惊不敢置信的目光下，直接落在了他的身上，将其肉身拍得粉碎，整个人化作了虚无。
这一幕，也同样是惊呆了神界深渊的尊者们以及母祖教那些尊者护法。就这样，大家都来不及弄清楚竹山府主的具体身份，他就已经死了。但毫无疑问，在这种关头竟然选择背叛神界深渊，竹山府主应该是母祖教一方的。
慧明这一爆，战力便已经不逊色于之前神界深渊一方众尊者中堪称最顶尖的寂灭大帝了。
与此同时，混沌飞舟之外，天云帝君来了。他的突然到来，也是让守在混沌飞舟之外的诸位主宰惊讶意外不已。
血刃神帝看到天云帝君本能般的目光一冷，身上杀意爆。天云帝君可是杀了他师父，打了他的脸。
而就在此时，乾合娘娘却是突然开口，说是她请天云帝君前来帮忙的，希望血刃神帝能够以这一方宇宙众生的安危为念，放下和天云帝君的过节。
众位主宰闻言先是惊讶的看了眼乾合娘娘，紧接着便都是目光落在了血刃神帝的身上。
同样有些意外看了眼乾合娘娘的血刃神帝，沉默片刻后，便是点头松了口：“好，为了我们这一方宇宙众生的安危，我可以答应，只要天云帝君全力相助，我们赢了飞舟内这一战，我和他的过节便了结了。”
“好！”乾合娘娘听得面露喜色，连对天云帝君道：“天云，赶紧进入飞舟吧！”
“血刃，我承认你很厉害。我不介意你愿不愿意和我了结之前的过节，如今我已报了仇，了无牵挂，唯一追求的便是在修炼之路上走得更远。将来，待我觉得自己实力足够了，会再来找你一战的，”天云帝君却是对血刃神帝冷漠说了声，才飞身进入混沌飞舟。
众位主宰听得略微愕然，不禁都是下意识的转头看向了血刃神帝，却没想到原本脸色冷漠的血刃神帝竟然是难得的嘴角露出了一抹笑意来。
血刃神帝本是冷漠的性子，作为神界深渊第一强者，自有其骄傲。不过，现在他倒是有些欣赏天云帝君了。或许，有这样一个对手，也不错！希望这天云帝君能够成长的快一些吧！他血刃，可是距离虚空神都只有一步之遥了。
实力完全不弱于慧明，甚至爆力比之还要更强一筹的天云帝君一加入，神界深渊一方虽然损失了不少尊者，可却依旧能够和母祖教一方一战。
但随着母祖教一方不顾一切，将所有尊者护法的分身都派出来后，神界深渊一方还是落入了下风。甚至疯狂之下的天云帝君，分身都战死了，不过他也是拼掉了实力最强的三大护法中其中两个的分身。
母祖教一方完全疯了，神界深渊一方刚损失了天云帝君，很快寂灭大帝也死了。最终，东伯雪鹰还是被逼动用黑葫芦，并成功将黑葫芦认主，借助黑葫芦的威能获胜。
混沌飞舟之战，神界深渊一方赢了。可母祖教并未放弃对修行者宇宙的觊觎，随着他们家乡宇宙接近毁灭，他们也是越加迫切的想要打败修行者一方的顶尖强者们，立下母祖祭坛，将这一方宇宙转化为适合他们生存的宇宙。