在清理附近的岛屿时，他们也碰到了不少小股的海盗，按照海盗们通常采用的登帮作战方式，他们是用枪排队枪毙的方法进行，结果海盗们无不因为这种作战方式被全歼。至于迫击炮，他们几乎根本就没有用，这种武器是留给西班牙海军的，小陈就等着他们前来围剿，并且他们也设计好了战术，看他们上不上勾，至于攻击马尼拉。小陈想也没有想。
终于在等了两个月后，前来清剿的西班牙海军船队到了，大约有十三艘军舰，型号要比明军的大上几倍，谢九城早就把情报送到了小陈手中。小陈用十艘油漆了海盗骷髅头的船把他们引进了港口，然后用安装了“铁牛”的军舰堵住了出口，环绕着西班牙军舰就用迫击炮猛炸，最终将这十三艘军舰歼灭在港口里面，军舰上的士兵投降大半。由于没有登岸，西班牙人在船上的步兵就直接被打死了大半，当这些俘虏被押到山沟里之后，小陈就命令堵住山口，全部杀死，替死去的华人报仇。
缴获的武器、弹药和大明士兵使用的不配套，就发给了岛上的华人。十三艘军舰由于没有伤到承重结构，经过维修后全部可以使用，至于说没有机械手段怎么修理，别忘了那些被先前俘虏的华人海盗们，修理这些被打烂上层建筑的军舰对于他们来说根本不是难事，海盗那有什么船坞啊，不管好看不好看，好用就行，所以这些都不是问题。至于让谁开这些军舰，都是华人，在小陈的*下，这些海盗没有不害怕的，很快就招满了人员。