来护儿长江一役大获全胜后，除了派遣郑成功北上夺取燕子矶之外，大部分时间都在整编南陈的降卒，因为这些降卒前身大多是某些家族的私兵，若是就这样一股脑地收了，很有可能会出现意想不到的情况。
为了削弱江南士族在南陈降军当中的影响力，来护儿不惜采用了最血腥的手段，将近四十名江南士族子弟全部屠杀，将所有陈军编制打乱，所有军官全部降为小卒，依据才能重新选拔。也正是因为如此，原来一向用兵迅猛的来护儿竟然足足耽误了八天时间。
八天后，来护儿率领着近六万大军浩浩荡荡地北上，进入了新近被郑成功攻占的燕子矶大营。
刚入营寨，郑成功就向来护儿禀报了金陵城内的南陈皇帝陈深已经写了降表，送到了自己面前，只是自己官职卑微，无权处置此等大事，只好等来护儿到来。
来护儿身后的来整听了郑成功的话后，眼神中闪过一丝厌恶，“这些墙头草，变换门庭到还真快！”
郑成功冷哼一声道：“这些世家大族历来如此，不过大将军，卑职拿下燕子矶大营时还抓获了一人，他自称自己是南陈派去求见陛下的使者，一开始被活捉时态度极其嚣张，非说他是使者，让我们放他去见陛下，情绪激动时还直呼陛下之名！”
“真是大胆！”来整怒哼一声，“此等贼子若是撞到我早被我一剑刺死！”
郑成功阴阴一笑，“来六将军息怒，虽然末将没有一剑刺死他，不过也好好地招呼了他一顿，到现在他还没有办法走路呢！”
来整大笑道：“干得好，成功！”
来护儿的嘴角虽然也挂起了一丝微笑，但他还是强憋住了笑意，问道：“那成功，他说了他去见陛下是去干什么的吗？”
郑成功收起了笑容道：“这家伙表面上硬气，但实际上就是个软骨头，我没用什么刑他就全招了。他说他是在半月前奉命前去拜见陛下，表明他们江南士族愿意归顺大隋的意愿，并提出废除张居正的清田司的要求，不过这家伙和燕子矶大营守将关系极好，两人相见大宴了一场，宿醉了四五天，因此误了行程！”
“废除清田司，哼，这些士族果然死不悔改！”来护儿极其厌恶地冷哼了一声，“我大隋为何会叛乱四起？还不都是因为这些无耻的家伙，贪婪无度，疯狂地侵占土地，农民活不下去了才会起来造反，居然敢提出这样的条件，这群废物也不看看自己有几两本事？”
“呼——”
来护儿深吸了一口气，凝神说道：“成功，你和整儿率军留守此地，我亲率大军前往金陵！”
郑成功闻言心生不妙，脑海中突然有了一个不妙的念头，结结巴巴地说道：“大将军，你...你要做..什么？”
来护儿深吸了一口气说道：“江南人心不附，士族私心太甚，若是不以雷霆手段镇压，恐怕难以长治久安，若是江南不稳，陛下便难以北伐重振大隋。”
“可是大将军。。。”郑成功忍了很久还是说道：“屠戮上千士族，这等罪名足以定你的死罪，纵使陛下饶你一命，您也会淹没在士人的唾沫之中，恐怕终身都难以有所作为。”
“食君之禄，分君之忧！”
来护儿字正腔圆地说道：“江南乃是鱼米之乡，将来必是我朝的第一粮仓！若是内中不稳，必定影响陛下的北伐大业。一旦时间长了，这天下必定再次陷入南北分裂、战乱不断的局面，为了报答陛下对我来护儿的厚恩，这千古骂名，我来护儿替陛下背上！”
“更何况现在已经有了接替我的人，我来护儿今年已经五十有七了，征战沙场三十多年，也累了，也该退下来了！成功，你的才能远胜于我，我留你和整儿在燕子矶，是希望你们不要和这件事有任何的牵连。我走后，你一定要好好地训练这支水师，完成我未竟的心愿，扬我大隋国威于四海之外！”
郑成功虎目含泪，拱手说道：“末将谨遵大将军教诲！”
来护儿又扭头看向来整，“六郎，为父数子当中唯有你文武双全，最像为父，我来家的将来就交给你了！”
“孩儿...遵尊父命！”
来护儿又小心叮嘱了一番，召集全军将领宣布道：“弟兄们，本将已经获得可靠情报，南陈伪帝陈深虽然献了降表，但这只不过是南陈贼子的奸计。这些贼子歹毒至极，打算趁我军入金陵之后借机在犒军的酒水里下毒将我们全部毒死，索性皇天有眼，让本将提前得知了他们的奸计，现在本将命令，全军杀奔金陵城，剿灭一切负隅顽抗之敌！”
“杀，杀，杀！”
隋军将官听了来护儿的话之后，个个义愤填膺，一个个振臂高呼大喊着发泄心中的愤怒，恨不得立刻杀尽金陵城将这些企图暗害他们地奸贼悉数杀光！
来护儿摆了摆手，沉声说道：“来整，郑成功，我给你们一万人马驻守燕子矶，以防南陈军偷袭。其余众将，随我杀进金陵，剿灭奸贼。记住，我们是去除贼，不是去烧杀抢掠，胆敢趁乱扰民者，一律斩首示众！”
“末将遵令！”
来护儿率领近五万精兵如虎狼似的杀向了金陵城，金陵城的守军已经知道了他们的皇帝陛下已经献了降表，根本没有料到来护儿会率军攻城，猝不及防之下被杀的溃不成军，城门外两座城防大营的陈军只坚持了不到半个时辰便全军覆没，两万余人被俘，来护儿留下一员偏将和五千